Za vsako pasmo je sprejet samostojni rejski program, ki pa jih zaradi obsežnosti gradiva ne objavljamo na tem mestu. Zadnji izvodi rejskih programov so vedno na voljo v knjižnici Oddelka za zootehniko na Biotehniški fakulteti. Strokovno delo, ki ga predpisujejo rejski programi, je povzeto na teh straneh. Sprejeti so rejski programi za spodaj naštete pasme ovc in koz.

Ovce jezersko-solčavska (JS) oplemenjena jezersko-solčavska (JSR) belokranjska pramenka (BP) bovška (B) istrska pramenka (IP)

Koze slovenska srnasta (SR) slovenska sanska (SA) burska (BU) drežniška (DR)

Za oplemenjeno bovško (VFB) pasmo ovc ni samostojnega rejskega programa in se vključuje v posebni razdelek rodovniške knjige pri rejskem programu za bovško pasmo. Prav tako ni samostojnega rejskega programa za ovce pasmo teksel (T). Se pa ta pasma vključuje v rejske programe drugih pasem ovc za potrebe gospodarskega križanja.